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Le CITET joue un rôle de premier plan dans les processus de coopération et de transfert des technologies environnementales des pays producteurs, situés au Nord, vers les pays du Sud, et notamment en Tunisie et dans la région arabo-africaine et méditerranéenne. Dans ce cadre, le centre  propose son expertise et son conseil en matière de technologies de l’Environnement, avec des partenariats stratégiques dans le cadre de  réseaux technologiques pour l’environnement.

En matière de recherche appliquée et de transfert des technologies, le centre assure :

• Le Transfert et l’innovation des techniques et technologies environnementales ;
• La mise en place de pépinières d’entreprises dans les domaines des éco-technologies ;
• Le développement des résultats de la recherche scientifique et des inventions pour aboutir à la phase de production ;
• L’instauration d’un partenariat avec les industriels et les chercheurs en vue de développer des techniques environnementales ;
• La mise en œuvre des programmes de recherche-développement et de Transfert des technologies à travers des projets pilotes et de démonstration répondant à la fois aux besoins des opérateurs publics et privés et aux exigences du développement durable.

Les principaux thèmes de recherche  sont : 

• Energies renouvelables (valorisation énergétique des déchets organiques, biométhanisation, Production d’énergie éolienne, Biocarburants…) ;
• Traitement et valorisation des eaux usées (Assainissement rural, Traitement biologique des margines) ;
• Traitement et valorisation des déchets solides (Valorisation des déchets organiques par compostage, valorisation des margines),
• Transfert et adaptation des Technologies (Réseaux technologiques, Transfert des Technologies)